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1.
Rev. argent. microbiol ; 47(2): 103-107, June 2015.
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1147118

ABSTRACT

La espectrometría de masas, conocida como matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS), es una técnica utilizada en la identificación de microorganismos mediante la creación de un espectro basado en el perfil de proteínas, que es único para una especie dada. El objetivo del presente trabajo fue evaluar la identificación de aislamientos clínicos de levaduras por MALDI-TOF MS en un hospital universitario de Argentina y analizar 2 procedimientos para la extracción de proteínas: el recomendado por el fabricante del equipo y una técnica abreviada rápida. Utilizando el primero de estos procedimientos se analizaron 201 aislamientos identificados previamente por métodos convencionales y se obtuvo coincidencia en la identificación a nivel de especie en el 95,38% de los aislamientos analizados. Con 100 de estos aislamientos se utilizó, además, el procedimiento abreviado para la extracción de proteínas; se obtuvo una identificación correcta a nivel de género y especie en el 98,0% de ellos. La espectrometría de masas MALDI-TOF MS demostró ser una técnica rápida, sencilla y precisa para la identificación de levaduras


The matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry technique known as MALDI-TOF MS is a tool used for the identification of clinical pathogens by generating a protein spectrum that is unique for a given species. In this study we assessed the identification of clinical yeast isolates by MALDI-TOF MS in a university hospital from Argentina and compared two procedures for protein extraction: a rapid method and a procedure based on the manufacturer's recommendations. A short protein extraction procedure was applied in 100 isolates and the rate of correct identification at genus and species level was 98.0%. In addition, we analyzed 201 isolates, previously identified by conventional methods, using the methodology recommended by the manufacturer and there was 95.38% coincidence in the identification at species level. MALDI TOF MS showed to be a fast, simple and reliable tool for yeast identification


Subject(s)
Mass Spectrometry/methods , Yeasts/isolation & purification , Spectrometry, Mass, Matrix-Assisted Laser Desorption-Ionization/methods , Fungal Proteins/analysis , Evaluation Study
2.
Rev. argent. microbiol ; 43(4): 268-272, dic. 2011. ilus
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-634703

ABSTRACT

Se presenta el primer caso humano de peniciliosis por Penicillium marneffei observado en la República Argentina. El paciente era un joven de 16 años, HIV-positivo, procedente de un área rural del sur de China. El paciente fue internado en el Hospital "F. J. Muñiz" por padecer una neumonía grave con insufciencia respiratoria aguda. El agente causal fue aislado de un lavado broncoalveolar y se lo observó en un citodiagnóstico de piel. La identifcación de P. marneffei fue confrmada por las características fenotípicas del aislamiento y la amplifcación del ADNr. El enfermo padecía una infección muy avanzada por HIV que condujo a la aparición simultánea de infecciones por citomegalovirus, Pneumocystis jirovecii y procesos bacterianos nosocomiales. Este complejo cuadro derivó en una evolución fatal.


The frst case observed in Argentina of AIDS-related human penicillosis is herein presented. The patient was a six- teen year-old young man coming from a rural area of southern China. He was admitted at the F. J. Muñiz Hospital of Buenos Aires city with severe pneumonia and adult respiratory distress. Penicillium marneffei was isolated from bronchoalveolar lavage fuid and was microscopically observed in a skin cytodiagnosis. P. marneffei identifcation was confrmed by rRNA amplifcation and its phenotypic characteristics. The patient suffered an advanced HIV infection and also presented several AIDS-related diseases due to CMV, nosocomial bacterial infections and Pneumocystis jirovecii which led to a fatal outcome.


Subject(s)
Adolescent , Humans , Male , AIDS-Related Opportunistic Infections/microbiology , Dermatomycoses/microbiology , HIV-1 , HIV-2 , Lung Diseases, Fungal/microbiology , Penicillium/isolation & purification , AIDS-Related Opportunistic Infections/epidemiology , Argentina/epidemiology , Bronchoalveolar Lavage Fluid/microbiology , China/ethnology , Cytomegalovirus Infections/complications , Diagnosis, Differential , DNA, Fungal/analysis , Dermatomycoses/epidemiology , Fatal Outcome , Histoplasmosis/diagnosis , Lung Diseases, Fungal/diagnosis , Lung Diseases, Fungal/epidemiology , Pneumocystis carinii , Polymerase Chain Reaction , Penicillium/classification , Pneumonia, Pneumocystis/complications , Ribotyping
3.
Acta odontol. latinoam ; 20(1): 17-22, 2007. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: lil-483938

ABSTRACT

Las levaduras del genero Candida colonizan el biofilm subgingival.Su hallazgo constituye un reservorio favorable para su multiplicación. El propósito de éste trabajo fue investigar la presencia de levaduras del género Candida en el biofilm subgingivalde individuos con enfermedad gingivoperiodontal a fin de establecer la prevalencia de especies y los perfiles desusceptibilidad a fluconazol y voriconazol de las mismas. Se obtuvieron muestras del biofilm subgingival en cien pacientes inmunocompetentes, no fumadores, con salud gingivoperiodontal, gingivitis y periodontitis, con y sin aparatologíabucal. Las muestras se sembraron en medio cromogénico diferencial y las levaduras aisladas se identificaronmediante micromorfología y pruebas bioquímicas. Los estudios de sensibilidad a fluconazol y voriconazol se realizaron según las normas CLSI M44-A. La prevalencia de levadurasen el biofilm subgingival fue del 40 por ciento IC95 por ciento (30.5-50.3) siendo el 10 por ciento y 30 por ciento la frecuencia de las mismas para los pacientes sin y con aparatología bucal respectivamente.C. albicans fue la levadura más frecuente. Encontramos otras especies como C. parapsilosis, C. dubliniensis, C. tropicalis, C. guilliermondii y C. sake. Solo se observó resistencia a los azoles en C. dubliniensis y C. guilliermondii. El tratamiento con aparatología bucal incrementó la prevalencia de levadurasen bolsa periodontal en forma significativa. Es importante destacar la presencia en el fluido subgingival de especies de Candida no albicans consideradas emergentes y con sensibilidad disminuida a los antifúngicos como C. dubliniensisy C. guilliermondii


Yeasts colonize the subgingival biofilm, which becomes a reservoir that favors their reproduction. The purpose of the present work was to determine the prevalence of yeasts of the Candida genus in the subgingival biofilm of gingivoperiodontal disease patients, including users and non-users of dental devices, and their susceptibility to fluconazole and voriconazole. Samples of subgingival pockets of immunocompetent nonsmokers showing gingivitis and periodontitis were inoculated in a differential chromogenic medium. Sixty three percent of subjects used dental devices. Yeasts were identified and susceptibility to fluconazole and voriconazole was tested following CLSI M44-A standards. The prevalence of yeasts in the subgingival biofilm was 40% CI 95% (30.5-50.3); 10% were patients who did not use dental appliances. The most frequently observed yeasts were C. albicans, and C. parapsilosis, C. dubliniensis, C. tropicalis and C. guilliermondii. Only C. dubliniensis and C. guilliermondii showed resistance to azoles. The use of dental devices significantly increased the prevalence of yeasts in periodontal pockets inpatients presenting gingivitis. It is noteworthy that non albicans Candida species, such as C. dubliniensis and C. guilliermondii, considered emerging species, which have a diminished susceptibility to antifungal agents were found in the crevicular fluid of immunocompetent patients.


Subject(s)
Humans , Male , Female , Adolescent , Adult , Middle Aged , Antifungal Agents/pharmacology , Orthodontic Appliances/adverse effects , Candida , Periodontitis/microbiology , Dental Plaque/microbiology , Candida/isolation & purification , Drug Resistance, Fungal , Fluconazole/pharmacology , Gingivitis/microbiology , Microbial Sensitivity Tests , Pyrimidines/pharmacology , Triazoles/pharmacology
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